宇宙世纪0093年，成为新吉恩总帅的夏亚·阿兹纳布尔对依然被地球重力所束缚的人类灵魂感到绝望，决心以激烈的手段加以肃正。查知此事的地球联邦军王牌驾驶员阿姆罗·雷及其所属的朗德·贝尔舰队一起与夏亚所领导的新吉恩军展开最后的决战……